MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Neisseria meningitidis alpha710 chromosome

Total Repeats: 8394

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017505	CTGC	2	8	2389	2396	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2	NC_017505	CGC	2	6	2461	2466	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3	NC_017505	TTC	2	6	2476	2481	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_017505	A	8	8	2494	2501	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017505	TTA	2	6	3539	3544	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017505	CAA	2	6	5951	5956	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_017505	CA	3	6	6220	6225	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8	NC_017505	T	6	6	6264	6269	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017505	TCTT	2	8	8506	8513	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_017505	CCG	3	9	8584	8592	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11	NC_017505	TGG	2	6	9891	9896	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017505	A	7	7	10054	10060	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017505	T	7	7	10082	10088	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017505	TGG	2	6	10097	10102	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017505	GCT	2	6	10145	10150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_017505	ATTTA	2	10	14541	14550	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017505	T	6	6	14604	14609	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017505	TAAA	2	8	14655	14662	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017505	TAAA	2	8	14673	14680	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017505	A	7	7	14678	14684	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017505	GAT	2	6	14686	14691	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017505	T	8	8	14724	14731	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017505	ATC	2	6	14741	14746	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_017505	T	7	7	14756	14762	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017505	T	6	6	14809	14814	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017505	TTG	2	6	14844	14849	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017505	GTG	2	6	15023	15028	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017505	A	6	6	15030	15035	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017505	TCAG	2	8	15065	15072	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
30	NC_017505	CAT	2	6	15163	15168	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_017505	ATG	2	6	15185	15190	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017505	CCTG	2	8	15473	15480	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
33	NC_017505	ATCC	2	8	15495	15502	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_017505	A	6	6	15648	15653	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017505	T	6	6	15727	15732	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017505	ATG	2	6	15745	15750	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017505	A	6	6	15778	15783	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017505	AAT	2	6	16750	16755	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017505	CGA	2	6	16870	16875	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_017505	GCC	2	6	16877	16882	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
41	NC_017505	A	6	6	16898	16903	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017505	A	6	6	17060	17065	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017505	GGC	2	6	17213	17218	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_017505	AT	3	6	17253	17258	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017505	CCA	2	6	17264	17269	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
46	NC_017505	GAC	2	6	17275	17280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_017505	CTTGC	2	10	17285	17294	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
48	NC_017505	ATTT	2	8	17359	17366	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017505	GGAAA	2	10	17915	17924	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017505	TTG	2	6	17977	17982	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017505	TAT	2	6	17994	17999	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017505	GTT	2	6	18062	18067	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017505	TTTC	2	8	18080	18087	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
54	NC_017505	T	6	6	18123	18128	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017505	T	6	6	18175	18180	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017505	GT	3	6	18218	18223	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017505	GGGT	2	8	18269	18276	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017505	TGGG	2	8	18277	18284	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017505	AATTT	2	10	18293	18302	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017505	GTG	2	6	18345	18350	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017505	ATC	2	6	18373	18378	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_017505	AAC	2	6	18440	18445	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_017505	TCG	2	6	19483	19488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_017505	ATG	2	6	19675	19680	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017505	CCG	2	6	19725	19730	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
66	NC_017505	ATG	2	6	20504	20509	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017505	CCG	2	6	20554	20559	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
68	NC_017505	AAC	2	6	20593	20598	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_017505	ATG	2	6	20702	20707	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017505	CCG	2	6	20752	20757	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
71	NC_017505	AAC	2	6	20791	20796	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_017505	ATG	2	6	20900	20905	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017505	A	6	6	20933	20938	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017505	CCGCT	2	10	20945	20954	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
75	NC_017505	ATG	2	6	22548	22553	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017505	CCG	2	6	22598	22603	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
77	NC_017505	TTG	2	6	23370	23375	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017505	GAT	2	6	23680	23685	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017505	TAAA	2	8	23736	23743	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017505	A	7	7	24741	24747	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017505	CGG	2	6	26964	26969	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_017505	A	7	7	28835	28841	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017505	GGCTTG	2	12	28928	28939	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_017505	A	6	6	28943	28948	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017505	GGGA	2	8	28949	28956	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017505	TGCC	2	8	28994	29001	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
87	NC_017505	A	11	11	29041	29051	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017505	CTCG	2	8	29059	29066	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
89	NC_017505	GCC	2	6	29634	29639	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
90	NC_017505	CGGG	2	8	29673	29680	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
91	NC_017505	T	6	6	29695	29700	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017505	TCG	2	6	29889	29894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_017505	ATA	2	6	31532	31537	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017505	TAT	2	6	31538	31543	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017505	TCA	2	6	31544	31549	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_017505	GTTC	2	8	31555	31562	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
97	NC_017505	GGC	2	6	33596	33601	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_017505	GCCTT	2	10	33657	33666	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
99	NC_017505	TCG	2	6	33694	33699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_017505	AT	3	6	33736	33741	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017505	GCAGG	2	10	33743	33752	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
102	NC_017505	CTG	2	6	33807	33812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_017505	A	6	6	35112	35117	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017505	GGA	2	6	35526	35531	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017505	GGGT	2	8	36995	37002	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017505	CGC	2	6	39097	39102	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
107	NC_017505	CCG	2	6	40521	40526	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
108	NC_017505	A	6	6	40530	40535	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017505	GGC	2	6	40582	40587	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_017505	TG	3	6	42176	42181	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017505	CAG	2	6	43595	43600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_017505	AAC	2	6	43780	43785	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_017505	ATG	2	6	43964	43969	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017505	A	6	6	44147	44152	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017505	CGG	2	6	44214	44219	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_017505	GC	3	6	44259	44264	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
117	NC_017505	CCCGT	2	10	44268	44277	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
118	NC_017505	T	7	7	47508	47514	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017505	CAATT	2	10	47601	47610	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
120	NC_017505	A	6	6	47701	47706	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017505	GTG	2	6	47734	47739	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017505	AAC	2	6	47797	47802	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_017505	CGAA	2	8	48000	48007	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
124	NC_017505	CT	4	8	48175	48182	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
125	NC_017505	TCG	2	6	50503	50508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_017505	CTT	2	6	51872	51877	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_017505	GCG	2	6	51900	51905	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_017505	CTT	2	6	51931	51936	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_017505	CGGG	2	8	51952	51959	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
130	NC_017505	TGC	2	6	51961	51966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_017505	CCCGC	2	10	51969	51978	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
132	NC_017505	CCG	2	6	51998	52003	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
133	NC_017505	TG	3	6	52022	52027	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017505	TTGG	2	8	53102	53109	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017505	AAC	2	6	53119	53124	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_017505	GAAT	2	8	54294	54301	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017505	A	7	7	55138	55144	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017505	ATG	2	6	55162	55167	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017505	T	7	7	55241	55247	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017505	GGC	2	6	55690	55695	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_017505	AGG	2	6	55759	55764	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017505	GGA	2	6	55766	55771	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017505	TTG	2	6	55777	55782	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017505	GGC	2	6	55785	55790	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_017505	GCA	2	6	55791	55796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_017505	A	6	6	55809	55814	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_017505	A	7	7	55847	55853	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_017505	TTC	2	6	55901	55906	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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286	NC_017505	TATAAG	2	12	76527	76538	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
287	NC_017505	AGA	2	6	76549	76554	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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290	NC_017505	CA	3	6	82809	82814	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
291	NC_017505	CAGGAG	2	12	82840	82851	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
292	NC_017505	CAA	2	6	82884	82889	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
293	NC_017505	ATT	2	6	82915	82920	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
294	NC_017505	CAT	2	6	82947	82952	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
295	NC_017505	TTGAT	2	10	83023	83032	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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314	NC_017505	AATT	2	8	83980	83987	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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328	NC_017505	T	6	6	87749	87754	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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424	NC_017505	ATCA	2	8	104623	104630	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
425	NC_017505	TTA	2	6	104645	104650	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
426	NC_017505	ATT	2	6	104665	104670	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
427	NC_017505	T	7	7	104687	104693	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
428	NC_017505	ATA	3	9	104699	104707	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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430	NC_017505	AAT	2	6	108114	108119	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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